Une autre légende de Les Encies est la découverte de la Vierge, d'où est née la source actuelle. Son nom semble provenir du mot latin incis qui en latin signifie incision ou coupure, puisque l'antique vierge a été trouvée au XIIe siècle dans une fissure sous l'ancienne église. La Vierge de Les Encies a été vénérée par les sages-femmes qui considèrent ses eaux comme miraculeuses.

Dans certaines légendes locales, celui qui est en danger invoque la Vierge de Les Encies pour intercéder auprès de lui.